Preparando la última semana

¡Buenas tardes a todos y bienvenidos al blog MIB!

Esta se presenta como la última semana de trabajos fuertes para el Máster de Ingeniería biomédica. Seguimos trabajando con el proyecto final de imagen, el informe divulgativo de electromagnetismo y salud y los papers de Medicina regenerativa.

Hoy ya hemos terminado todos los grupos de sacar las imágenes de fluorescencia de los miotubos. Muchos esperamos unos resultados poco favorables, pero como nos ha dicho Jacobo, estamos en una práctica nueva que roza más el mundo de la investigación que una mera práctica de la universidad.

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También hemos tenido esta mañana la última visita de la asignatura Nanotecnología. Mañana nos toca las presentaciones finales, así que deseadnos suerte.

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Un saludo,

La familia Bio

NGS y HPC, la presentación final

¡Buenas tardes a todos y bienvenidos al blog MIB!

¡HEMOS SOBREVIVIDO! Ese ha sido nuestro principal pensamiento tras presentar los dos trabajos de computación del año. Han sido unos trabajos largos, alguno de ellos ha llevado incluso la mitad de la asignatura.

EN High Performance Computing hemos estado estudiando y trabajando en distintas maneras para afrontar los distintos algoritmos existentes en la bioinformática. Hemos intentado usar varios de ellos, pero se ha convertido en una carrera en contra de los elementos, con servidores sin espacio, cuotas a pagar y librerías sin permisos para que las pudiéramos usar.

Con todo ello hemos salido con un buen conocimiento de las cosas que se pueden y no se pueden hacer con HPC.

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Para NGS hemos entregado nuestra réplica de un paper de Nature, aprendiendo las principales lineas de trabajo que se usan para RNA-Seq y ChIP-Seq (no tiene que ver con chips, son proteínas inmunoprecipitadas).

Tras una larga ronda de preguntas, Dr. Ander Muniategui salió contento de la clase, sabiendo que hemos aprendido lo que el quería: TODO.

Seguiré contando nuestras aventuras a medida que vamos acabando.

Un saludo,

La familia Bio

Práctica final de medicina regenerativa

¡Buenos días y bienvenidos al blog MIB!

Hoy ya hemos terminado las clases teóricas y prácticas de Regenerative medicine. Ya solo nos queda terminar fuera de clase el cuaderno de laboratorio y la inmensa cantidad de papers que nos pide preparar Jacobo, es decir, 2 papers.

Hemos empezado la clase con una parte teórica de problemas socio económicos y éticos que suponen los tratamientos de nueva generación. Tras ello hemos realizado un pequeño debate en clase.

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Después hemos empezado a realizar inmunotinciones para detectar los miotubos en las muestras que hemos cultivado en los scaffolds que preparamos hace unas semanas. Como toda tincion con incubaciones, ha sido bastante larga, ya que hemos acabado a las 4 de la tarde. Esperamos que las imágenes que saquemos merezcan la pena, aunque os mando un adelanto.

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Un saludo,

La familia Bio

Visita a CINFA

¡Buenas tardes a todos y bienvenidos al blog MIB!

Hoy hemos ido a visitar CINFA, con la profesora Maite Mujika, a visitar a Julio Maset.

CINFA es una empresa situada en Navarra, que empezó como industria del genérico, hasta convertirse en la mayor empresa farmacológica de España.

“Año 1969. Un grupo de farmacéuticos liderados por Ezequiel Lorca se propone recuperar el protagonismo del farmacéutico en el proceso de elaboración de los medicamentos creando un laboratorio que, dentro de la industria, mantuviera la esencia de la profesión y la misión de servicio al ciudadano.

Cuatro décadas después, este sueño es una realidad y nos hemos convertido en el primer laboratorio en España por unidades de medicamentos dispensadas en la oficina de farmacia*. De hecho, en cada hogar español hay, de media, seis medicamentos de Cinfa. Sin perder la esencia de nuestros orígenes, seguimos trabajando cada día para trasladar en cada proyecto los valores heredados de nuestros promotores.”

Tras una pequeña presentación inicial de las instalaciones, pudimos pasar a la zona donde se fabrica. Al ser GMP, nos tocó disfrazarnos un poco para poder entrar a las zonas “sucias” de las instalaciones.

IMG_20170516_100147Terminamos la visita con una pequeña visita al almacén, que parece un almacén de industria automovilística, con todo el movimiento que tiene y la velocidad de las máquinas.IMG_20170516_132710

Al salir, CINFA nos dio unos regalos, entre ellos un recuerdo de nuestra visita:

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Un saludo,

La familia Bio

Última clase de imagen

¡Buenos días a todos y bienvenidos al blog MIB!

Hoy hemos tenido la última clase de Análisis de imagen médica en la biomedicina. Nos hemos centrado en las aplicaciones que tiene la imagen médica de

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Hemos terminado la clase con una sesión de laboratorio para poder terminar nuestro proyecto final de la asignatura. Usando escaneos láser de un brazo tras realizar el test de prick, se analizan las pápulas que se producen. Usando análisis de imagen para a obtención de features y algortimps de Machine Learning, tenemos que entrenar modelos matemáticos para poder predecir si las pápulas que se obtienen son producto de una reacción alérgica o no.

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Un saludo,

La familia Bio

 

Cultivando miotubos

¡Buenas tardes y bienvenidos al Blog MIB!

Hoy hemos disfrutado de otra clase de Regenerative medicine. En la primera parte de la clase hemos disfrutado de una clase de Dr. Jacobo Paredes de bioreactores, de la industrialización de procesos para que no sean tan aparatosos en un laboratorio y se puedan automatizar y pasar a volúmenes mayores.

Todas estas técnicas son igual de importantes que la propia tecnología inicial, ya que van a permitir que todos los cultivos celulares se abaratan y puedan pasar a ser una práctica clínica habitual.

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Como actividad de grupo, nos tocó salir a varias personas de cada grupo a diseñar y exponer un bioreactor para cada tejido que estamos diferenciando. ¿Que nutrientes necesita? ¿Qué condiciones? ¿Volumen? ¿Intercambio de gases?

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Todo ello bajo la atenta mirada de Ander y de Virginia, que veían como puede salir una generación de ingenieros que entienden de verdad los problemas de laboratorio y de la clínica moderna.

La parte de laboratorio ha sido bastante sencilla. Hemos

Un saludo,

La familia Bio

Otra visita a Pamplona

¡Buenas noches a todos y bienvenidos al blog MIB!

Hoy hemos tenido en Electromagnetismo y salud una clase sobre los tratamientos y diagnósticos que existen en el mercado que usan RF, como puede ser una resonancia, un marca pasos, etc….

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Tras ello, hemos ido en autobús a nuestra última visita del máster a la CUN. En ella hemos visto varios departamentos, que usan RF para secar tumores y tratarlos por ablación. También hemos visitado la unidad de arritmias, donde se realizan mapeos al corazón para poder operar con mayor precisión y curar o aliviar las arritmias de los pacientes. Todo ello mano a mano con ingenieros que están al otro lado de la pared para indicar al médico donde se produce el mal funcionamiento eléctrico del corazón.

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Todo gracias al profesor Daniel Vanderas, que nos ha acercado un poco más a la aplicación de la ingeniería a la medicina en campos que no creíamos tan ingenieriles.

Un saludo,

La familia Bio