Empieza la vuelta a la rutina

Buenos días y bienvenidos al blog MIB!

Hemos tenido unas merecidas vacaciones, que todos hemos aprovechado para desconectar un poquito. Algunos hemos vuelto a casa, como Javi a Madrid y Luisvi a Miranda, a visitar un poco a la familia.

Otras han visitado la nieve, disfrutando de los últimos resquicios que quedan en esta temporada. Nos han pasado fotos para dar un poco de envidia.

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Dicho esto, mientras algunos preparan la mochila para mañana, otros pillan el tren de vuelta a Donostia.

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Un saludo,

La familia Bio.

Un master más por el mundo

Buenos días y bienvenidos de nuevo al blog MIB!

Ya es Semana Santa, así que no voy a poder contar muchas cosas de que hacemos en clase. Lo malo es que puedo contar muchos trabajos que nos toca realizar en estas fechas y sería un poco deprimente, así que lo mejor es hablar de cosas un poco más felices. Un antiguo compañero de este máster presentó proyecto en Pamplona el pasado miércoles 5 de abril.

Guillermo Miguel Besné, alumno de la escuela e ingeniero biomédico, presentó Simul-eye (http://www.unav.es/simul-eye/), una plataforma virtual que permite a los alumnos de medicina de todo el mundo practicar y aprender la mayoría de patologías oculares existentes. Ha sido recibido con gran ilusión por parte de médicos, empresas de simulación y docentes, pero no tanto por alumnos, ya que se rumorea que puede ser material de examen.

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Felicidades Guillermo por este proyecto.

Un saludo,

La familia Bio

Histología en Biodonostia

Buenas tardes a todos y bienvenidos al blog MIB!

Hoy ha sido un día realmente intenso. Hemos visitado Biodonostia para poder realizar las pruebas de histología del grupo 2, intentando conseguir cartílago. Fuimos con el temor a que también se hubieran contaminado (SPOILER: estaban bien).

Tras una pequeña clase sobre histología, lo primero de todo fue la parafina y cortar con el microtomo. Virginia nos dejo dos intentos: Ortzi y Luisvi, primero bien y segundo mal.

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Seguidamente volvimos con los portas a los laboratorios de Tecnun para hacer las tinciones. Mientras se realizaban, en los tiempos de espera se pudo hablar con los profesores invitados a la práctica.

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Al final de la mañana (una hora más tarde del final de la clase, pero merecía), Ander y Virginia nos pudieron explicar los resultados, usando un microscopio y un televisor para que viéramos los resultados

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Con esto pudimos ver que el grupo 2 había conseguido su diferenciación. Enhorabuena!

Un saludo,

La familia Bio.

Primeros días de semana

Buenas tardes  a todos y bienvenidos al blog MIB!

Esta semana avanza como todas, llenas de trabajos a más no poder. El lunes empezamos con Implants, a la tarde Imagen con un tema nuevo sobre registro (para los que no lo sepáis, el registro es alinear imagen) y ya por fin a casa a descansar.

El martes tuvimos clase de Sistemas embebidos con un nuevo padre en el mundo, Maykel, que acaba de tener un hijo. Dentro de su nueva apretada agenda encontró un poco de tiempo para explicarnos el software Processing, para la generación de GUIs (Graphical User Interface). Estas GUIs nos permiten mostrar al usuario los datos que nos llegan del arduino.

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A la tarde última clase teórica de Bioprocessos, con una lección de controladores PID. Aprendimos lo necesario que es el control a tiempo real para poder ahorrar en un sistema tan grande como una depuradora.

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Terminamos la tarde con Daniel en su última clase de Electromagnetismo y salud, aunque ahora toca su gran proyecto de la asignatura: calcular el SAR y el calor de un móvil cercano al cuerpo. ¿Es peligroso nuestro smartphone? En unas semanas lo sabremos.

Un saludo,

La familia Bio

Malas noticias

Buenas tardes y bienvenidos de nuevo al blog MIB!

Hoy escribo contando malas y extrañas noticias. Las células del grupo 1 han muerto devoradas por bacterias. También las del grupo 3. también las de los profesores. Pero solo las de medio diferenciado.

Sí, todo lo que he contado es muy raro. Solamente han muerto las células en diferenciación de todos los grupos, siendo los medios distintos. Es muy raro, pero es lo que hay.  Los profesores de medicina regenerativa van a repetir el experimento en Biodonostia para que podamos llegar a los pasos finales.

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Perdón por el meme, pero era necesario para calmar la pena.

La familia Bio

Imagen con demostración

Buenos días a todos y bienvenidos al blog MIB.

Esta semana sin Regenerative Medicine se nos va a hacer un poco más corta, pero aun así nos va a tocar currar bastante.

Hoy lunes en Analysis of Biomedical Image hemos visto distintos algoritmos y formas de representar las imágenes que tenemos en el ordenador al usuario. De todas las formas que hemos visto, quiero resaltar Hololens, con las cuales el profesor nos dejo jugar un rato.

Después realizamos una práctica bastante chula. Usando 3D slicer hemos usado imágenes de resonancia magnética para generar modelos del esqueleto humano y del corazón, creando STL que se pueden imprimir en casa con una impresora 3D.

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Un saludo,

La familia Bio

HPC & NGS

¡Buenos días a todos y bienvenidos al blog MIB!

Hoy voy a escribir una entrada breve. Se acerca el fin de semana y ya todos estamos cansados.

Esta semana no hemos tenido Regenerative Medicine, pero sigue tocando ir a cuidar a nuestas pequeñas células, que crecen estupendamente y comen dos veces por semana.

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En HPC – High Performance Computing, hemos tenido la visita del i2basque, un cluster presnte en el parque tecnolggico de miramon, que se puede usar gratuitamente para estudios académicos. Como parte de la asignatura vamos a enviar trabajos al cluster y a Aazon We Services, con el fin de no tener el portatil trabajando durante 8 meses para obtener lo mismo que en el cluster en unas horas.

En NGS – Next Generation Sequencing hemos continuado con las prácticas de la semana anterior, una vez ya dominamos linux. Las prácticas consisten en buscar splicing alternativo entre pacientes resistentes y sensibles a un medicamento. Para ello hemos analizamos RNA-seq proveniente de muestras paired-end de Illumina, aunque por ahora solo hemos analizado el gen UMPS. Usando IGV se pueden ver las lecturas realizadas y la presencia de transcritos.

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Volveré a escribir pronto, lo prometo.

La familia Bio